新病毒的出現，沉重打擊了靠著一股勇往直前的精神來開發銀河系的人類。致命病毒在多處人口稠密的殖民地同時爆發。無數的學者和醫生為了戰勝新病毒無不竭盡全力，但通常實驗未果就感染病毒紛紛死亡。人類對新病毒的瞭解只有一點，那就是症狀與當年毀滅地球和太陽系的阿肯病毒相似。被病毒感染的人露出極度興奮和好戰性，最後殺害他人或互相廝殺身亡。感染阿肯病毒的人最長可生存至7天，但只要染上新型病毒，8小時內就能喪生，無一例外。
    最可怕的是，這種新病毒不只致死率高，其駭人的傳染能力也是阿肯病毒無法相比的。它能在超高溫和超低溫下活動，並藉由各種媒介途徑快速傳染，爆發災情後的短短短數小時，病毒通過運輸船、定期航班的聯絡船、個人的小型宇宙船，紛紛傳播到未感染地區。
     全銀河系90%的人類瞬間死亡。
     人類唯一的生存方法是切斷所有與外界的聯絡。
    索波克是阿肯學會的成員，阿肯即「神秘」之意。這個學會由一群喜歡神秘考古的科學家和業餘愛好者組成，研究著非主流科學，所以這個學會也被主流科學界諷刺地稱為「供暴發戶消遣的無聊學會」。由於沒有得到權威學術界的認可，學會中科學家的項目分析結論，常遭到大眾的貶低和冷落。
    為了阻斷病毒的擴散，尚未感染的地區，決斷地破壞了與外界的聯繫平台，甚至切斷了所有通信。幸運的是，部分地區沒被這種致命的病毒感染，包括了島玄博士居住的營區。島玄博士大膽推測，這致命的新病毒與過去的阿肯病毒有關，他和阿肯病毒研究室的學者將新的病毒命名為「神秘阿肯變種病毒」。
在切斷與外界通信的前夕，他拿著從感染地區送來的數據開始了研究。不久之，阿肯病毒研究室所在的拉布蘭營區發生令人震驚的事件，就是發現了營區內極有可能存在神秘變種病毒。但是未知的原因使得神秘變種病毒停止了生命跡象，像進入潛伏期的病原體，隱藏了自己的原貌。
    為了確認所發現的潛伏病毒是否為「神秘阿肯變種病毒」，阿肯病毒研究室的學者，活化了所發現的病毒。當神秘變種病毒被活化後， 5名研究人員立即遭受感染，在8小時之內紛紛喪生。原以為慘劇的幕廉將於拉布蘭營區再度升起，但是病毒不久後卻因不明原因，終止了生命跡象。島玄博士和阿肯病毒研究室的成員認為，使該病毒停止活動的原因，應該是拉布蘭營區特有的環境所造成，因為這一切都是在把所有交通和通信設施毀壞後才發生的。但是，他們仍無法證實自己的推測。
    就算於拉布蘭營區發送通信信號，其他營區的人類也未必能收到。但是阿肯病毒研究室的成員為了人類生存，還是全力嘗試對外的聯絡。他們一方面研究拉布蘭營區的環境，另一方面努力讓其他營區人員獲知這個訊息。原本營區和營區的遠距離通信只能通過平台進行，但是所有營區的通訊平台已經毀壞，希望隨著越來越多的挫折，終究成了泡影。

    此時，阿肯病毒研究室的成員得知，拉布蘭營區中心發現從全新未知的礦物－「魔石」。這種神奇礦物比人類歷史中所發現的任何一種礦物，都來的更有強大威力。
    拉布蘭營區的地方政府特別隱瞞此事，連開發也在秘密中進行。這項大發現－「魔石」，使得變種阿肯病毒慘劇漸漸地從人們記憶中消失。當然，阿肯病毒研究室的成員密切注意這項新物體，並推測因為魔石的出現，才使得阿肯病毒變種病毒無法活動。研究指出，魔石會發出特殊波長，一種被譽為靈魂波長的能量，這個能量和侵入人類大腦造成極度刺激好戰性的阿肯病毒變種病毒，兩者可能存有著某種關聯性。

    島玄博士說服同事加緊腳步來研究魔石，他發現，魔石可以與具有思考能力的生物，直接進行靈魂交流，並且可以利用本身強大的爆發力轉換為龐大的新能源。島玄博士認為，魔石的靈魂波長對不明飛行船的操控者產生了部份影響，否則屠殺中的飛行船是沒有理由撤回的。
     島玄博士的研究再也無法繼續下去了，因為隸屬於政府的防衛軍也成為暴徒的情況下，失去了所有的防衛及資金援助。島玄博士聚集了與他有相同想法的研究人員，意欲逃離G-06星球。他需要在一個安全的環境中繼續研究魔石，這可能是人類生存的唯一希望。島玄博士和阿肯病毒研究室成員逃出G-06星球後不久，營區外圍的不明飛行船突然爆炸，猛烈的爆炸將拉布蘭營區推向死亡之地。

    逃脫出拉布蘭營區的島玄博士一行人，開始了往不明飛行船的相反方向無限航行。他們為了找出人類可以生存的營區，而在銀河系中漂泊。但是，沒有一個營區回應他們的信息。儘管如此，他們在維持航行的同時仍必須繼續進行研究。雖然島玄博士的同伴們一個接一個地死去，但他從未因此喪失信心，他堅信，一定還有人類存活的行星。這也是可以支撐他存活的意志。倖存的阿肯病毒研究室成員在人類所開發的銀河空間裡，花費了30年的歲月，苦苦找尋人類的痕跡。

我們終於找到了尚有人類氣息的行星。我和倖存的兩名同伴，終於能將我們的秘密，也就是想滅絕人類的希律族陰謀揭穿了。但是，我們所找到僅存人類的各行星現象，使我們的希望成為了泡影。我和我的同伴們親眼目睹了人類在諾爾斯中心的罪行，目睹了人類對人類所做的一切，目睹了「地球聯合」在新人類研究計劃的美名之下，所進行的那些行為。